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“小身材,大能量” —— GenapSys测序系统

发布日期:2020-03-06

一种新颖且强大的测序系统已经问世,对于所有需要使用测序技术的实验室来说,GenapSysTM测序系统都具有无可比拟的优势。小巧的GenapSysTM测序系统采用CMOS(互补金属氧化物半导体)芯片技术,结合电子数据检测,通过实践验证的边合成边测序技术提供高精确的测序数据。


GenapSys
TM 测序系统具有极强的应用优势
  • 快速且低成本的优势,满足不同测序应用场景中不同类型样本的检测需求

  • 客户能够轻松掌握从开始到结束的整个测序流程

  • 实现对样本完整性和数据分析结果的高可信度保证

  • 经济、灵活的测序设备与运行流程,适合所有类型的实验室

  • 只需更换不同类型的芯片,无须更换测序仪,即可实现不同数据通量的测序要求


CMOS测序芯片包含数百万个单独的传感器,每个传感器都转载着一个克隆扩增的珠子;当碱基和珠子上的模板配对结合时,每个传感器的电极测量阻抗的微小变化;当加入一个核苷酸时,该传感器的测量阻抗值会有变化,形成一个类似楼梯的图形。关于信号变化的信息,会归为不同信号,不同信号的大小与加入碱基的数量相关。

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图中展示了一个典型的数据获取示例。显示了单个模板序列通过不同核苷酸流时被测到的不同信号的分布,有核苷酸流入的用红色表示;没有核苷酸流用蓝色表示,没有明显偏离的是基线;所测得的序列,包括每个掺入碱基的数目。

GenapSysTM 测序系统的工作流程


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▶ 文库制备
GenapSysTM 测序仪采用第三方兼容的文库制备方案,灵活方便。其测序数据性能已经在GenapSys的测序仪上进行了验证。

▶ 克隆扩增
加入混合后的文库并装载所需的耗材后,只需要一个简单的运行设置过程。一旦开始运行,GenapSys的测序准备系统会在4小时内自动完成克隆扩增的全过程,且无需任何实验人员值守。

▶ 测序
扩增后的模板加入到测序芯片中,友好的系统界面将引导用户进行耗材装载与测序运行设置。GenapSys的测序系统采用高精确的边合成边测序技术提供高质量的测序数据。

▶ 数据分析

测序运行输出文件为标准的FASTQ文件,兼容现有的二级数据分析工具来分析GenapSys产生的数据。为了获得高质量的结果,GenapSys建议客户使用GenHub,这是一个专用的云端分析解决方案,参数经过测试和优化。可以对GenapSys数据进行二级分析,避免了昂贵的本地化服务器的配置需求。GenHub还可以为客户提供测序运行状态的实时监控和全部运行数据的FASTQ和VCF文件的处理能力。(本地化服务器数据分析方案正在开发中)

GenapSysTM测序系统目前可以使用16M芯片,一次运行可产生1.2-2.0Gb数据,能提供检测罕见变异和稀有转录本所需的高分辨率和灵敏度。


灵活的通量满足各种不同的测序应用需求


▶ 16M芯片的主要参数

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▶ 初始据输出量为1.2-2.0Gb的16M芯片的测序应用范围:

  • Targeted resequencing

    -Amplicon based

    -Hybridization capture based

    -Long-range PCR

  • Small genome sequencing

  • Gene editing validation

  • 16S rRNA-sequencing

  • Targeted mRNA sequencing

  • Small RNA sequencing

  • Targeted single cell assay sequencing


 可在16M或144M芯片上运行的应用范围:(144M芯片预计在2020年上市)

  • Highly multiplexed targeted panels
  • Exomes
  • Transcriptomes
  • Single cell gene expression

GenapSysTM 测序系统性能及准确性数据


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Fig. 1 
IGV visualization of two heterozygous SNPs in the RUBCN gene.
The GenapSys platfrom has been validated against market leading systems over various genomic samples in third party expert labs with >80% bases >Q30. The platform with the 16M chip is capable of generating 1.2 - 2.0 Gb of high-quality sequence data in a single run and delivers the high resolution and analytical sensitivity needed for detection of rare variants and transcripts. Routine performance exceeds 99% accuracy with an average read length of >150 bp.

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Fig. 2
 Correlation of allele frequencies measured from sequencing data generated by GenapSys and an established sequencing platform. Sequenced libraries were generated from the Oncospan Reference DNA standard enriched using a pan cancer hybrid capture panel.

2019年12月,上海迪赢生物科技有限公司与GenepSys达成经销协议,成为其中国地区的经销商。
如果您有合作意向,请将您的需求通过电子邮件发送给迪赢生物
迪赢邮箱:diying@dynastygene.com

Ordering information

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参考资料来源于GenapSys, Inc

公司介绍 

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Golden Gateway Partners, LLC
是由Matt Levy先生与Christopher Yoo博士作为联合创始人,并由多位医疗保健、生命科学与信息技术行业的资深从业人士组成合伙人团队,旨在为环太平洋地区的科技公司提供全面的商业咨询与管理服务。
Golden Gateway Partners始终致力于帮助企业取得商业成功,是您走向国际业务成功,与进入新兴市场的最佳商业合作伙伴。无论您或您的公司是一个刚刚进入国际市场的新手,还是您需要更有效率的管理现有业务,在Golden Gateway Partners的合伙人团队,您都可以轻松地找到协助您在海外扩展业务所需要的全部资源。
如果您有合作意向,请将您的需求通过电子邮件发送给迪赢生物
迪赢邮箱:diying@dynastygene.com


合作伙伴
GenapSys, Inc是一家总部位于美国加州湾区红杉城的基因测序设备供应商。GenapSys由Hesaam Esfandyarpour博士创立于2010年。在创立GenapSys之前,Esfandyarpour博士和他的团队就在斯坦福大学基因组技术研究中心开发了几种用于DNA测序和蛋白质检测的新技术。哈佛大学遗传学教授George Church是公司的科学顾问。

2019年12月,GenapSys正式推出其高通量低成本的迷你NGS测序仪,使用互补金属氧化物半导体(CMOS)芯片,以专有的电微流控测序芯片为中心,利用电子信号检测碱基连接情况,24小时内可提供超过1000万条平均长度为150bp的reads。

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